Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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