Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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IFT88Q13099 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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IFT88Q13099 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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IFT88Q13099 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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IFT88Q13099 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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IFT88Q13099 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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