Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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TRAF1Q13077 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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TRAF1Q13077 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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TRAF1Q13077 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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TRAF1Q13077 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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TRAF1Q13077 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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