Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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STRN3Q13033 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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STRN3Q13033 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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