Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms