Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PTPRJQ12913 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PTPRJQ12913 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PTPRJQ12913 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PTPRJQ12913 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PTPRJQ12913 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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PTPRJQ12913 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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PTPRJQ12913 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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PTPRJQ12913 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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