Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms