Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.4□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 394.7 ms