Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms