Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms