Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms