Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms