Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TLE4Q04727 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TLE4Q04727 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TLE4Q04727 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TLE4Q04727 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TLE4Q04727 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TLE4Q04727 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TLE4Q04727 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TLE4Q04727 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TLE4Q04727 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TLE4Q04727 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TLE4Q04727 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TLE4Q04727 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TLE4Q04727 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms