Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms