Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms