Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COG7P83436 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COG7P83436 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COG7P83436 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COG7P83436 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COG7P83436 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COG7P83436 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms