Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2IP63279 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms