Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNRPD3P62318 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNRPD3P62318 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms