Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UFM1P61960 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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