Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms