Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIRAP54198 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms