Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HK3P52790 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HK3P52790 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms