Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1P51787 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms