Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms