Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUFMP49411 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUFMP49411 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUFMP49411 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms