Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms