Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP5P45974 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP5P45974 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP5P45974 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP5P45974 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP5P45974 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP5P45974 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP5P45974 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP5P45974 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP5P45974 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP5P45974 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP5P45974 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP5P45974 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP5P45974 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP5P45974 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP5P45974 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP5P45974 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP5P45974 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms