Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms