Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GDF5P43026 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GDF5P43026 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GDF5P43026 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GDF5P43026 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GDF5P43026 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GDF5P43026 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GDF5P43026 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GDF5P43026 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GDF5P43026 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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