Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJB2P29033 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms