Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMBRP28336 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
NMBRP28336 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms