Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA5P28066 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA5P28066 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms