Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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