Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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