Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms