Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms