Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF1P22415 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF1P22415 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms