Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCP2P22307 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms