Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPAN8P19075 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN8P19075 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN8P19075 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms