Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF4P18085 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms