Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB4P16144 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms