Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms