Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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TMEM225BP0DP42 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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