Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC172P0C7W6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms