Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYBBP04839 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYBBP04839 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYBBP04839 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYBBP04839 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYBBP04839 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYBBP04839 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYBBP04839 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYBBP04839 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYBBP04839 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYBBP04839 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms