Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIPP01282 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIPP01282 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIPP01282 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIPP01282 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIPP01282 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIPP01282 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIPP01282 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIPP01282 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VIPP01282 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VIPP01282 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VIPP01282 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms