Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POP4O95707 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POP4O95707 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms