Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms