Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms