Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms